Į tolimesnį etapą nepavyko prasibrauti Eidinburgo "Hearts", kurie nors ir įveikė namuose Zagrebo "Dinamo" 2-0, tačiau svečiuose buvo pralaimėję net 0-4.
Pakliūti į grupės etapą nepavyko ir Anglijos "Aston Villa" ekipai, kuri namuose nors ir įveikė Vienos "Rapid" 2-1, tačiau pirmajame mače austrai buvo laimėję, rezultatu 1-0.
Savo varžovus tiesiog sutrypė "Roma" ekipa. Pirmajame mače nugalėtojas nepaaiškėjo, susitikimas baigėsi 3-3. Tuo tarpu Romoje šeimininkai įveikė "Kosice" net 7-1. "Hatt-tricku" pasižymėjo puolėjas Francesco Totti.
Rezultatai:
(Paryškintos komandos pateko į kitą varžybų etapą)
Aktobe 0 - 2 Werder Bremen
Amkar Perm 1 - 0 Fulham
FK Karabakh 0 - 0 Twente Enschede
Dynamo Moscow 1 - 2 CSKA Sofia
Hapoel Tel Aviv 1 - 1 Teplice
Olomouc 1 - 1 Everton
Hertha BSC 3 - 1 Brondby
Slovan Bratislava 1 - 2 Ajax Amsterdam
Zenit St. Petersburg 1 - 1 Nacional
CFR Cluj 2 - 1 FK Sarajevo
Lille 4 - 2 Racing Genk
SC Heerenveen 0 - 0 PAOK Saloniki
Elfsborg 1 - 0 Lazio
Tromso 1 - 1 Athletic Bilbao
Austria Vienna 3 - 2 Metalurg Donetsk
Metalist Kharkiv 0 - 1 Sturm Graz
Basel 5 - 1 FK Baku
Zilina 0 - 2 Partizan Belgrade
AEK Athens 3 - 0 FC Vaslui
Sparta Prague 1 - 0 NK Maribor
Tallinna FC Levadia 1 - 1 Galatasaray
Fenerbahce 2 - 2 Sion
Liberec 0 - 3 Dinamo Bucuresti
Hamburger SV 3 - 1 Guingamp
OB Odense 1 - 1 Genoa
Red Star Belgrade 2 - 1 Slavia Prague
Villarreal 6 - 1 NAC Breda
Hearts 2 - 0 Dinamo Zagreb
Austria Vienna 3 - 2 Metalurg Donetsk
Litex Lovech 0 - 4 BATE Borisov
AS Roma 7 - 1 Kosice
PSV Eindhoven 1 - 0 Bnei Yehuda Tel Aviv
St. Patricks 1 - 2 Steaua Bucuresti
Vorskla Poltava 2 - 1 Benfica
Aston Villa 2 - 1 Rapid Vienna
Toulouse 0 - 1 Trabzonspor
Club Brugge 1 - 0 Lech Poznan
Valencia 4 - 1 Stabaek